O LAPEEX conta com dois espaços físicos, sendo um laboratório de análises e um laboratório de experimentos:

Laboratório de Análises

Está localizado no prédio principal do Instituto de Ciências Humanas e da Informação (ICHI), no Campus Carreiros da FURG. Trata-se de um espaço de 41,20 m² com mesas de análise de materiais arqueológicos, estantes para acondicionamento dos equipamentos e coleções de referência e réplicas arqueológicas/paleontológicas; armários para acondicionamento do acervo bibliográfico (livros e periódicos); estantes para acondicionamento temporário de materiais arqueológicos sob análise; dois computadores para uso dos pesquisadores e discentes; forno para tratamento térmico de rochas lascáveis; pia para lavagem de materiais.

Laboratório de Experimentos a Céu Aberto

Trata-se de um campo localizado no Campus Carreiros da FURG (próximo ao ILA e à estação meteorológica), de aproximadamente meio hectare, utilizado para reprodução e manutenção de sítios arqueológicos simulados; experimentos de produção de artefatos líticos, cerâmicos e ósseos; produção de grafismos rupestres simulados; utilização experimental dos artefatos, como uso de projéteis (arco e flecha, dardos, etc.); e atividades didáticas de métodos e técnicas de prospecção e escavação arqueológica, e registros rupestres.